孕期流產的開始通常表現為陰道出血量較少，常為暗紅色或咖啡色的分泌物，並伴有時下腹部隱痛，即為先兆流產。經過醫生處理和休息，大多數情況下症狀會消失，可以繼續懷孕。但是如果症狀加重，出血增多，下腹痛明顯，甚至陰道排出肉樣的組織物，那麼流產是不可避免的，即為難免流產。
如果難免流產的妊娠物完全排出，出血會逐漸減少，腹痛減輕，這就是完全流產，一般不需要特別處理。如果妊娠物沒有完全排出，出血仍然很多，腹痛明顯，這就是不完全流產，大多數情況下需要緊急清宮。
孕早期流血最危險的原因是宮外孕，即受精卵沒有著床在子宮內膜，而是在子宮內膜以外的組織，其中95%發生在輸卵管。隨著胚胎的發育，輸卵管無法支撐越來越大的胚胎，絨毛穿透輸卵管壁，導致管壁破裂並大量出血，可能引起休克甚至死亡，但陰道出血量通常不會很多。如果有盆腔感染史、宮腔手術史或輸卵管手術史的婦女，應特別警惕宮外孕。
由於剖宮產的增多，目前剖宮產切口處妊娠也越來越常見，其危險在於妊娠物種植並穿透剖宮產疤痕，導致子宮破裂和大出血，並有生命危險，建議儘量順產。
葡萄胎是引起惡變的原因之一，患者通常會出現間歇性少量出血，但也可能反覆多次出現大量出血，有時在血液中還會發現水泡狀物。更嚴重的情況可能引起妊娠劇吐、妊娠高血壓等，因此，若出現這些症狀，需要進行B超檢查。治療主要是透過清宮手術，但需要注意的是葡萄胎有可能惡變為侵襲性葡萄胎，因此患者必須堅持定期複查。
此外，一些婦科疾病也可能引起早孕期陰道流血，如宮頸息肉。但宮頸病變引起的出血往往很難與流產引起的出血相區別，孕早期醫生通常會先處理先兆流產，以免造成損失。如果宮頸息肉較大，可以考慮在中孕期進行小手術將其摘除，以免繼續混淆。
此外，早期胚胎種植通常發生在月經週期相近的時候，可能會出現出血和輕微腹部不適。大多數情況下，休息幾天后症狀會自行緩解，不必過於擔憂。