1.藥物治療：目前常用於膽囊結石的藥物可以分為三類：抗生素、利膽中成藥和熊去氧膽酸類藥物。抗生素和利膽藥物主要用於緩解膽囊炎發作時的症狀；熊去氧膽酸主要用於解決膽泥淤積、泥沙樣小結石和膽固醇結晶等情況，但對於較大的結石通常無法溶解，儘管個別臨床病例中也有報道稱結石有所縮小。
2.手術治療：以下病情建議手術切除膽囊：膽囊萎縮，結石充滿膽囊，結石直徑超過3cm，膽囊壁明顯增厚炎症，症狀反覆發作，患者出現膽源性胰腺炎後伴有膽囊結石。對於其他手術情況，建議諮詢專科醫生。目前膽囊切除一般採用腹腔鏡手術，該技術已經非常成熟。
3.關於保膽手術：國內保膽手術的數量有所增加，但大部分是為了滿足患者對保留膽囊的需求。保膽手術並非新手術，實際上100多年前就已進行過保膽手術，但隨著醫學的進步，新的膽囊切除手術已經取代了此術式。保膽手術存在明顯的缺陷，例如如果膽囊結石較大或反覆發作需要手術切除，膽囊黏膜肯定會受到炎症損害，保留膽囊會帶來很多問題。如果結石較小且沒有症狀，為什麼不進行觀察和隨訪呢？此時結石對患者並沒有造成太大的影響。保膽手術不僅面臨手術風險，還有結石復發的問題，結石複發率超過80%，很多患者只是將膽囊分為兩次切除。有些患者甚至在保膽手術後仍有結石殘留。因此，目前大型醫院很少進行保膽手術。如果堅持進行保膽手術，患者需要考慮結石復發和二次膽囊手術的可能性。
4.碎石治療：與泌尿繫結石不同，膽囊結石如果碎裂會排入膽總管，易導致膽管炎、膽道梗阻，甚至出現胰腺炎等嚴重情況，這遠比膽囊結石本身更為複雜和嚴重。